學(xué)校前身是1926年5月創(chuàng)辦的上海東南醫(yī)學(xué)院。1949年底，響應(yīng)中共中央華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”的號召，東南醫(yī)學(xué)院內(nèi)遷安徽省，成為安徽省第一所高等醫(yī)科院校。1952年改名為安徽醫(yī)學(xué)院。1985年更名安徽醫(yī)科大學(xué)。

　　學(xué)校現(xiàn)有梅山路、翡翠路、第四臨床醫(yī)學(xué)院、巢湖臨床醫(yī)學(xué)院、阜陽臨床醫(yī)學(xué)院等5個(gè)校（院）區(qū)，校園占地面積2086畝，建筑面積73.85萬平方米，教學(xué)科研設(shè)備總值6.63億元；有20個(gè)直屬教學(xué)機(jī)構(gòu)，13所直屬附屬醫(yī)院，7所非直屬附屬醫(yī)院；在職教職醫(yī)護(hù)員工（含直屬附院）15163人；全日制在校生20367人，其中普通本科生14631人，碩士研究生4906人，博士研究生411人，留學(xué)生419人；有40個(gè)本科專業(yè)；有4個(gè)博士后科研流動(dòng)站，4個(gè)一級學(xué)科博士點(diǎn)，44個(gè)二級學(xué)科博士點(diǎn)，1個(gè)專業(yè)學(xué)位博士點(diǎn)，13個(gè)一級學(xué)科碩士點(diǎn)，76個(gè)二級學(xué)科碩士點(diǎn)，8個(gè)專業(yè)學(xué)位碩士點(diǎn)；擁有1個(gè)國家重點(diǎn)學(xué)科。